黄华孙研究员作为我国橡胶树遗传育种学科带头人，系统开展橡胶树选育种研究40年，有力推动了我国橡胶树育种学科发展和橡胶树品种及种植材料的升级换代。带领团队建设和完善了我国橡胶树种质资源评价技术体系，保存种质资源6462份，筛选创制耐寒抗风高产种质资源112份。选育出推广级品种13个，其中国审品种5个。热研73397具有高产稳产抗逆性强等特点，是我国第三代胶园主推品种；热研879是目前国际上已有报道的最高产品种。推动新品种在我国不同植胶类型区试种示范和推广应用，新品种在新植胶园中应用占比超过85%，推广300万亩以上，使我国自育良种面积占比从本世纪初的不足5%提高到38%，扭转了国外品种占主导地位局面。

主持国家重点研发计划项目、国家科技攻关计划、国家科技支撑计划、国家科技基础条件平台、国家自然科学基金、公益性行业（农业）科研专项等国家级和省部级科研项目40多项。获得国家科技进步三等奖2项：“中规模推广级橡胶树优良品种热研7-33-97的选育”（第1完成人），“中规模推广级橡胶树优良品种热研88-13的选育”（第4完成人）；以第1完成人获得海南省科技成果转化特等奖、中华农业科技一等奖、全国农牧渔业丰收奖农业技术推广贡献奖、海南省科技进步一等奖、海南省科技进步二等奖等省部级奖项8项；主编《橡胶树育种五十年》《橡胶树种质资源描述规范和数据标准》《天然橡胶产业发展战略研究-天然橡胶分册》《现代农业产业技术体系建设理论与实践-天然橡胶分册》《中国天然橡胶主要品种及系谱（1996-2020年）》《天然橡胶良种良法技术手册》等6部专著；获授权专利107件；以第一作者或通讯作者发表论文100余篇，其中“The rubber tree genome reveals new insights into rubber production and species adaptation”2016年发表在《Nature Plants》，是世界上橡胶树基因组测序发表的顶级论文，被大量引用。

作为国家天然橡胶产业技术体系首席科学家，牵头整合了我国天然橡胶主要科研力量，从育种、栽培、土肥、采胶、病虫防控、机械化、产品加工、生态到产业经济，从研发到示范，形成了产业链式研究体系，建成了全国性天然橡胶科研协作平台。